農業部長陳吉仲半個月來深陷巴西進口雞蛋爭議，成為朝野攻防焦點，陳吉仲19日晚間8點於臉書宣布“決定請辭”，而與進口雞蛋相關事務的中央畜產會董事長林聰賢也宣布請辭。對此，行政院發言人林子倫晚間以新聞稿回應，陳建仁尊重陳吉仲的決定，勉予准辭，並於21日生效，並指派農業部政務次長陳駿季暫代“農業部長”。
陳吉仲從2018年12月擔任農委會主委至今，歷經美國萊豬進口、農漁產品害蟲問題無法銷陸、2022年缺蛋事件等爭議，數次被在野陣營要求下台，卻穩如泰山，甚至在前行政院長蘇貞昌背起民進黨2022年地方選舉大敗“戰犯”之名，2023年1月底下台，陳吉仲仍為行政院長陳建仁所留任。他更在農委會升格為“農業部”後擔任首任“部長”。
“超思”公司進口巴西雞蛋爭議延燒半個月，行政院日前證實陳吉仲曾口頭向陳建仁請辭，但陳建仁並未准辭，要求陳吉仲應對外釐清進口雞蛋相關爭議。陳吉仲19日上午與立法院民進黨團總召柯建銘及幹部見面，會後陳吉仲首度為造成“社會紛擾”鞠躬道歉，但強調雞蛋專案進口政策正確，陳吉仲19日傍晚又召開臨時記者會親上火線說明，並再度鞠躬道歉。而面對媒體詢問請辭一事，陳吉仲表明，不會戀棧。
當外界以為陳吉仲將繼續留任，並與陳建仁在22日一起在立法院進行進口雞蛋專案報告時，陳吉仲19日晚間於臉書二度宣布請辭。
對此，林子倫在晚間9點左右以新聞稿回應，陳吉仲近日多次向陳建仁表達歉意，願負個人責任，19日晚間再度向陳建仁表達堅辭之意。陳建仁尊重陳吉仲的決定，勉予准辭，並於21日生效。
陳建仁認為，陳吉仲在過去幾個月積極處置，極力在符合消費者需求、維護蛋農生計、穩定市場價格間取得平衡，要做到面面俱到實屬不易，任務艱鉅且非常辛苦，而實際上，進口雞蛋專案也緩解了國內缺蛋狀況，並獲得穩定蛋價、打擊黑市等政策效益。
陳建仁說，然而，由於這是台灣首次採取規模性進口雞蛋政策，因過往經驗有限，使得在執行層面，有諸如冷鏈規範、調度管理、積極確認流向、社會說明等有不盡周延、多可精進之處，陳建仁請陳吉仲提出精進措施，作為未來政策之參考，並期盼相關政策能夠回歸理性討論。
林子倫指出，陳建仁已指派陳駿季暫代農業部長一職，並持續進行社會溝通說明，釐清各界疑慮，同時依照原訂規劃，於21日行政院會提出進口雞蛋專案的成效檢討與策進作為報告，行政院也將持續準備完整資料，於本22日向立法院提出專案報告。
